MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 56951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	ACC	2	6	206	211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163562
2	NC_007484	GCAA	2	8	261	268	50 %	0 %	25 %	25 %	77163562
3	NC_007484	ACA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163562
4	NC_007484	ATTG	2	8	316	323	25 %	50 %	25 %	0 %	77163562
5	NC_007484	TAT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163562
6	NC_007484	AGC	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163562
7	NC_007484	CTT	2	6	397	402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
8	NC_007484	AGGT	2	8	404	411	25 %	25 %	50 %	0 %	77163562
9	NC_007484	CAGCCT	2	12	424	435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77163562
10	NC_007484	CTT	2	6	476	481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
11	NC_007484	AGT	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
12	NC_007484	CAAT	2	8	558	565	50 %	25 %	0 %	25 %	77163562
13	NC_007484	GCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163562
14	NC_007484	ATGC	2	8	664	671	25 %	25 %	25 %	25 %	77163562
15	NC_007484	CGA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163562
16	NC_007484	T	6	6	835	840	0 %	100 %	0 %	0 %	77163562
17	NC_007484	T	7	7	868	874	0 %	100 %	0 %	0 %	77163562
18	NC_007484	AAT	2	6	909	914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163562
19	NC_007484	TGA	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
20	NC_007484	A	6	6	1259	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	77163562
21	NC_007484	ATC	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163562
22	NC_007484	GTA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
23	NC_007484	CTCGGC	2	12	1331	1342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77163562
24	NC_007484	TTC	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
25	NC_007484	GGT	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163562
26	NC_007484	TAC	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163562
27	NC_007484	TCG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163562
28	NC_007484	A	6	6	1506	1511	100 %	0 %	0 %	0 %	77163562
29	NC_007484	AGA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
30	NC_007484	GTA	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163563
31	NC_007484	ACG	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163563
32	NC_007484	TTGAAA	2	12	2541	2552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	77163563
33	NC_007484	AGA	2	6	2581	2586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
34	NC_007484	CTTC	2	8	2636	2643	0 %	50 %	0 %	50 %	77163563
35	NC_007484	AAG	2	6	2670	2675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
36	NC_007484	ATTC	2	8	2687	2694	25 %	50 %	0 %	25 %	77163563
37	NC_007484	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163563
38	NC_007484	ATT	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
39	NC_007484	TCA	2	6	2833	2838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163563
40	NC_007484	TAT	2	6	2865	2870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
41	NC_007484	GAA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
42	NC_007484	CTT	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163563
43	NC_007484	TTG	2	6	3165	3170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163563
44	NC_007484	CTG	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163563
45	NC_007484	TAA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163563
46	NC_007484	ATT	2	6	3386	3391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
47	NC_007484	AAG	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
48	NC_007484	TAG	3	9	3427	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163563
49	NC_007484	AGTA	2	8	3467	3474	50 %	25 %	25 %	0 %	77163563
50	NC_007484	TGT	2	6	3475	3480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163563
51	NC_007484	GAC	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163563
52	NC_007484	GCC	2	6	10550	10555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163564
53	NC_007484	T	6	6	10579	10584	0 %	100 %	0 %	0 %	77163564
54	NC_007484	AGA	2	6	10604	10609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163564
55	NC_007484	GCA	2	6	10612	10617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163564
56	NC_007484	ATCAT	2	10	10623	10632	40 %	40 %	0 %	20 %	77163564
57	NC_007484	TGG	2	6	10671	10676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163564
58	NC_007484	ATG	3	9	10692	10700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163564
59	NC_007484	GCCA	2	8	10791	10798	25 %	0 %	25 %	50 %	77163564
60	NC_007484	CTT	2	6	10802	10807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163564
61	NC_007484	C	6	6	10811	10816	0 %	0 %	0 %	100 %	77163564
62	NC_007484	GCG	2	6	10851	10856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163564
63	NC_007484	GAG	2	6	10880	10885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163564
64	NC_007484	CTG	2	6	10886	10891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163564
65	NC_007484	ACCC	2	8	10902	10909	25 %	0 %	0 %	75 %	77163564
66	NC_007484	TCA	2	6	10944	10949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163564
67	NC_007484	CGG	2	6	10987	10992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163564
68	NC_007484	GCTT	2	8	11010	11017	0 %	50 %	25 %	25 %	77163564
69	NC_007484	T	7	7	11035	11041	0 %	100 %	0 %	0 %	77163564
70	NC_007484	CAT	2	6	11065	11070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163564
71	NC_007484	TTC	2	6	11074	11079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163564
72	NC_007484	ATG	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163565
73	NC_007484	ATTT	2	8	11448	11455	25 %	75 %	0 %	0 %	77163565
74	NC_007484	AATT	2	8	11488	11495	50 %	50 %	0 %	0 %	77163565
75	NC_007484	CTG	2	6	11587	11592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163565
76	NC_007484	CAA	2	6	11609	11614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163565
77	NC_007484	TA	3	6	11662	11667	50 %	50 %	0 %	0 %	77163565
78	NC_007484	TCT	2	6	11670	11675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163565
79	NC_007484	TGT	2	6	11684	11689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163565
80	NC_007484	GGA	2	6	11697	11702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163565
81	NC_007484	TGG	2	6	11769	11774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163565
82	NC_007484	AACG	2	8	11782	11789	50 %	0 %	25 %	25 %	77163565
83	NC_007484	AGC	2	6	11794	11799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163565
84	NC_007484	AAG	2	6	11859	11864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163565
85	NC_007484	CT	3	6	11865	11870	0 %	50 %	0 %	50 %	77163565
86	NC_007484	ACCA	2	8	11959	11966	50 %	0 %	0 %	50 %	77163565
87	NC_007484	AGA	2	6	12020	12025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163565
88	NC_007484	AGC	2	6	12056	12061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163565
89	NC_007484	TGGA	2	8	12109	12116	25 %	25 %	50 %	0 %	77163565
90	NC_007484	TAT	2	6	12193	12198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163565
91	NC_007484	TGA	2	6	12233	12238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163565
92	NC_007484	ATC	2	6	12262	12267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163565
93	NC_007484	ACT	2	6	12318	12323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163565
94	NC_007484	AGA	2	6	12395	12400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163565
95	NC_007484	TAA	2	6	12408	12413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163565
96	NC_007484	CAA	2	6	12433	12438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163566
97	NC_007484	CTCAT	2	10	12461	12470	20 %	40 %	0 %	40 %	77163566
98	NC_007484	GTAT	2	8	12514	12521	25 %	50 %	25 %	0 %	77163566
99	NC_007484	GAT	2	6	12534	12539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163566
100	NC_007484	CAT	2	6	12552	12557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163566
101	NC_007484	CGA	2	6	12587	12592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163566
102	NC_007484	CAT	2	6	12623	12628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163566
103	NC_007484	TGA	2	6	12638	12643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163566
104	NC_007484	ACGG	2	8	12664	12671	25 %	0 %	50 %	25 %	77163566
105	NC_007484	AAG	3	9	12694	12702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163566
106	NC_007484	TGG	2	6	12743	12748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163566
107	NC_007484	TGG	2	6	12779	12784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163566
108	NC_007484	T	7	7	12832	12838	0 %	100 %	0 %	0 %	77163566
109	NC_007484	CAG	2	6	12867	12872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163566
110	NC_007484	T	6	6	12967	12972	0 %	100 %	0 %	0 %	77163566
111	NC_007484	AGA	2	6	13079	13084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163566
112	NC_007484	T	7	7	13086	13092	0 %	100 %	0 %	0 %	77163566
113	NC_007484	G	7	7	13097	13103	0 %	0 %	100 %	0 %	77163566
114	NC_007484	AATAAA	2	12	13128	13139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	77163566
115	NC_007484	ACTCC	2	10	13140	13149	20 %	20 %	0 %	60 %	77163566
116	NC_007484	T	6	6	13159	13164	0 %	100 %	0 %	0 %	77163566
117	NC_007484	TGCAA	2	10	13202	13211	40 %	20 %	20 %	20 %	77163566
118	NC_007484	T	8	8	13235	13242	0 %	100 %	0 %	0 %	77163566
119	NC_007484	AAT	2	6	13251	13256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163566
120	NC_007484	TGGC	2	8	13285	13292	0 %	25 %	50 %	25 %	77163566
121	NC_007484	AAG	2	6	13336	13341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163566
122	NC_007484	A	7	7	13350	13356	100 %	0 %	0 %	0 %	77163566
123	NC_007484	GAT	2	6	13377	13382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163566
124	NC_007484	GACT	2	8	13393	13400	25 %	25 %	25 %	25 %	77163566
125	NC_007484	TC	3	6	13406	13411	0 %	50 %	0 %	50 %	77163566
126	NC_007484	TCT	2	6	13437	13442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163566
127	NC_007484	T	6	6	13517	13522	0 %	100 %	0 %	0 %	77163566
128	NC_007484	GGC	2	6	13554	13559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163566
129	NC_007484	GAT	2	6	13562	13567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163566
130	NC_007484	GCT	2	6	13572	13577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163566
131	NC_007484	AGC	2	6	13589	13594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163566
132	NC_007484	AG	3	6	13605	13610	50 %	0 %	50 %	0 %	77163566
133	NC_007484	CAG	2	6	13720	13725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163566
134	NC_007484	TCG	2	6	13751	13756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163566
135	NC_007484	TTC	2	6	13768	13773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163566
136	NC_007484	GAA	2	6	13881	13886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163566
137	NC_007484	ATC	2	6	13909	13914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163566
138	NC_007484	ATT	2	6	13917	13922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163566
139	NC_007484	GACG	2	8	13928	13935	25 %	0 %	50 %	25 %	77163566
140	NC_007484	ACGC	2	8	13958	13965	25 %	0 %	25 %	50 %	77163566
141	NC_007484	T	8	8	13976	13983	0 %	100 %	0 %	0 %	77163566
142	NC_007484	CCT	2	6	14034	14039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163566
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145	NC_007484	TTATC	2	10	14229	14238	20 %	60 %	0 %	20 %	77163566
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155	NC_007484	GCTA	2	8	14959	14966	25 %	25 %	25 %	25 %	77163567
156	NC_007484	ATT	2	6	14989	14994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163567
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160	NC_007484	AGC	2	6	15237	15242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163567
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162	NC_007484	TAA	2	6	15308	15313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163567
163	NC_007484	TTA	2	6	15407	15412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163567
164	NC_007484	CT	3	6	15453	15458	0 %	50 %	0 %	50 %	77163567
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246	NC_007484	G	9	9	21735	21743	0 %	0 %	100 %	0 %	77163571
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252	NC_007484	ATC	2	6	22082	22087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163572
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256	NC_007484	GTA	2	6	22329	22334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163572
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258	NC_007484	GCTT	2	8	22392	22399	0 %	50 %	25 %	25 %	77163572
259	NC_007484	T	6	6	22423	22428	0 %	100 %	0 %	0 %	77163572
260	NC_007484	GGC	2	6	22465	22470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163572
261	NC_007484	GCA	2	6	22486	22491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163572
262	NC_007484	ACT	2	6	22497	22502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163572
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264	NC_007484	CTGC	2	8	22564	22571	0 %	25 %	25 %	50 %	77163572
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